最近注目の分野をあつかう。マイクロバイオームとは環境での微生物コミュニティー全体を意味し、腸内細菌相はその一部である。人間は顕微鏡の発明で不可視の生物だった微生物を発見し、病気との関連を明らかにしたり産業への応用を行って来た。そして、20世紀半ばには大腸菌を用いて分子生物学の土台を成す知見が華々しく得られたが、微生物学の革新は世紀終わりには役割を終えたかにも見えた。微生物学研究の要は培養法だったが、実は環境中の微生物の99-95%が培養不可能で、腸内細菌についてもその事情は同じだった。しかし、次世代シーケンサーと情報アルゴリズムがこの状況を変えた。各種微生物のゲノムDNAの断片の混合物から、もとの細菌集団の種類と量についての情報をえられるようになったのだ。これで、腸内細菌相の実態を初めて知る事ができたし、人体内部の無菌であろうと考えられていた臓器にも例外無くマイクロバイオームが存在する事が分かった。特に注目度が高いのは、腸内細菌のマイクロバイオームが与える健康への影響の大きさである。腸内細菌がその代謝を通じて腸内の免疫系に影響し、肥満、神経系の発達（鬱や自閉症とも関連）に影響するのだ。この分野は、まだ始まったばかりでこれからの発達に期待がかかっている事を本書は強調している。
始めの部分に、本当に基礎的な事から分子系統学の初歩まで簡単におさらいしているが、何も知らない読者がこれで理解できるとは思えない。しかし、物事の因果関係が気になる読者のための記述であり、ここが理解できなくてもその後の記述や内容理解には大きな問題にはならないと思う。聞き慣れない微生物の属名などもあまり気にしないで読めばよい。一応巻末に用語集もついているし、さらに知りたい読者のための原著論文一覧もついている。
最後に些末な事だが、枯草菌の遺伝子数1794個（P31）とあるが、これは間違いで枯草菌(Bacillus subtilis)の遺伝子数は株により多少は違うが、通常4000前後である。また枯草菌にはblpCと言う遺伝子はない(P28)。この遺伝子はバクテリオシン生産に関わる定足数検知型フェロモンの遺伝子でStreptococcus thermophilusが持つ。この菌はヨーグルト製造に使われている乳酸菌で遺伝子数は約1800である。この菌との混同と思われる。
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